Totalt har 22 kommuner utfärdat obligatoriska evakueringsorder för omkring 29000 människor i cirka 12000 hushåll. Ytterligare 100 kommuner manar till evakuering.
Minst två människor har omkommit och elva har skadats. En man miste livet när han passerade en byggställning vid en byggarbetsplats i Fukuoka. En 70-årig man dog när han försökte bärga sin båt som slitit sig i stormen.
Ovädret har gjort att hundratals flygavgångar har ställts in och det är störningar i tågtrafiken. Och lokalt varnar meteorologer bland annat för att våldsamma vindar och höga vågor.
Lan har nedgraderats från "supertyfon", men klassas av Japans meteorologiska myndighet JMA som "väldigt stor" i sitt omfång och "väldigt stark" i sin intensitet. Orkanens centrum ligger söder om Japan, men utkanterna har drabbat flera landsdelar.
Under måndagsdygnet slår det till mot Tokyo. Fordonstillverkaren Toyota håller sina fabriker stängda under måndagen.